昭和31年、日本の政財界を裏で牛耳る龍賀一族が支配する哭倉村。帝国血液銀行に勤める水木は、龍賀一族の当主・時貞の死の弔いを建前に、ある密命を背負って村を訪れる。
一方、後に鬼太郎の父となる男は、行方不明になった最愛の妻を捜すため村へやって来る。
龍賀一族の跡継ぎを巡って醜い争いが始まる中、神社で一族の者が惨殺される事件が次々と起こる。
2023年11月;に好意視された『鬼太郎誕生 ゲゲゲの謎』の映像と音をクオリティアップした新たなバージョン。 327カットのリテイク。リテイクカットの中には絵コンテで当初想定されていた恐怖演出を復活させたのでPG12からR15+になっている。
しかし、大満足しながらもどこがどう違っていたかは皆目わからなかった。ただ、懐かしい鬼太郎の音楽は少なくなっていたので残念。
